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流式細(xì)胞術(shù)是現(xiàn)代生物學(xué)研究中的一項重要技術(shù)。它zui初主要用于細(xì)胞的熒光分析以及標(biāo)有熒光抗體的細(xì)胞分選，當(dāng)然，這仍是現(xiàn)階段的主要應(yīng)用。但zui近，流式細(xì)胞儀的應(yīng)用范圍正在迅速擴大。在介紹性的評論中，Kalisky和Quake討論了流式細(xì)胞儀在單細(xì)胞分析中的作用，并談及了它在基因組測序和基因表達中的新興作用。其中，Navin等的一篇文章介紹了從腫瘤細(xì)胞中分離單個流式分選的核，接著進行全基因組擴增和單細(xì)胞基因組的測序，以研究腫瘤發(fā)展。而Brind'Amour則描述了另一種流式細(xì)胞學(xué)方法，它通過FISH對重復(fù)基因組DNA進行分析。

在甲基化分析中，流式細(xì)胞儀已應(yīng)用在癌癥生物標(biāo)志物的尋找上。通過定量臨床血漿和糞便樣品中的DNA甲基化來尋找生物標(biāo)志物，如Li等的文章。盡管流式細(xì)胞儀在臨床和預(yù)臨床研究中的流行，但這項技術(shù)的復(fù)雜度也限制了它在監(jiān)控臨床試驗中的應(yīng)用。在一篇發(fā)表在《Nature Immunology》上的評論中，Maecker等提出了一個流程，讓使用流式細(xì)胞儀監(jiān)控的多中心臨床試驗的實驗可變性降至zui低程度。流式細(xì)胞儀目前不僅僅用于哺乳動物細(xì)胞的研究。根據(jù)Stoeckius等，它還用于分期的線蟲胚胎的篩選，以分析RNA表達。而Suzuki等則通過反復(fù)交配和單缺失株的富集創(chuàng)建出帶有多個缺失的釀酒酵母。另外，Mayer等采用熒光激活細(xì)胞分選來富集細(xì)胞特異的適體（aptamer）。

《Nature Methods》的主編Daniel Evanko認(rèn)為，這些例子僅僅是目前進展中的一部分，無疑流式細(xì)胞術(shù)將繼續(xù)發(fā)展，作為新技術(shù)被采用，并開發(fā)出新的應(yīng)用。之前，流式細(xì)胞儀一直被認(rèn)為是精密復(fù)雜的儀器，需訓(xùn)練有素的專人操作，且價值不菲，一般實驗室只能望而興嘆。但近年來一些主流生物技術(shù)企業(yè)相繼推出了新型流式細(xì)胞儀，不單將原本需要一支工程師隊伍進行安裝的大型設(shè)備壓縮成為可以單人運送的緊湊型儀器，而且操作更加簡單，價格也更加實惠。